Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCFC2P16383 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms