Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2F2P13984 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2F2P13984 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms