Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFTRP13569 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CFTRP13569 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFTRP13569 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CFTRP13569 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CFTRP13569 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CFTRP13569 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CFTRP13569 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms