Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA4P12838 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms