Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMP3P12645 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP3P12645 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms