Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKBP12277 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKBP12277 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKBP12277 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKBP12277 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKBP12277 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKBP12277 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKBP12277 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKBP12277 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKBP12277 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKBP12277 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKBP12277 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKBP12277 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKBP12277 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms