Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT3P12035 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT3P12035 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT3P12035 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT3P12035 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT3P12035 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT3P12035 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms