Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM225BP0DP42 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms