Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms