Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFTA3P0C7M3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms