Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP3P08254 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP3P08254 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP3P08254 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms