Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRPRAP08240 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRPRAP08240 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms