Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NGFRP08138 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NGFRP08138 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NGFRP08138 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NGFRP08138 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NGFRP08138 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms