Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM2P07951 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM2P07951 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM2P07951 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM2P07951 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms