Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINC1P01008 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms