Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2P00734 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2P00734 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
F2P00734 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
F2P00734 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
F2P00734 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2P00734 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2P00734 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2P00734 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2P00734 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms