Protein–RNA interactions for Protein: O95863

SNAI1, Zinc finger protein SNAI1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI1O95863 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI1O95863 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI1O95863 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms