Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms