Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8BO95263 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8BO95263 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8BO95263 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8BO95263 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms