Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF6O75683 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF6O75683 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF6O75683 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF6O75683 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF6O75683 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SURF6O75683 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SURF6O75683 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms