Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGR5O75473 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGR5O75473 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGR5O75473 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms