Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN3BO60391 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN3BO60391 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN3BO60391 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms