Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KIAA0556O60303 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KIAA0556O60303 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms