Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD5O60279 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms