Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL3O43909 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL3O43909 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms