Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR2O43760 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms