Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPRY3O43610 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms