Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM2O43147 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM2O43147 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms