Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD28O15084 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms