Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C1D1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C1D1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C1D1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C1D1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C1D1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C1D1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C1D1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C1D1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C1D1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C1D1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H7C1D1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H7C1D1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C1D1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C1D1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C1D1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms