Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
E9PCH4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
E9PCH4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
E9PCH4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
E9PCH4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
E9PCH4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E9PCH4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
E9PCH4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms