Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP99D6REC4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms