Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DIRC3C9JPN6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DIRC3C9JPN6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms