Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NOTOA8MTQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NOTOA8MTQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms