Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSDA5PKW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms