Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA8A3KMH1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA8A3KMH1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms