Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE3A1L190 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms