Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLRN2A0PK11 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLRN2A0PK11 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms