Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms