Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms