Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TRBV20-1A0A075B6N2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TRBV20-1A0A075B6N2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TRBV20-1A0A075B6N2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV20-1A0A075B6N2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV20-1A0A075B6N2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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