Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms