Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM2Q9Y333 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms