Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO2Q9Y2G9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBNO2Q9Y2G9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms