Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ICE1Q9Y2F5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms