Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC11AQ9Y240 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC11AQ9Y240 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms