Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC5Q9UQL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms