Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms