Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms