Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms